如果乙肝和丙肝合并感染，应先检测乙肝病毒DNA、乙肝五项和丙肝病毒RNA。
如果乙肝病毒DNA和丙肝病毒RNA均为阳性，可同时口服抗乙肝病毒药和抗丙肝病毒药物治疗。
如果丙肝病毒RNA阳性、乙肝病毒DNA阴性，但乙肝表面抗原阳性，在口服抗丙肝病毒药物治疗时有可能发生乙肝病毒再激活的风险，故在应用抗丙肝病毒治疗期间和停药后三个月内联合抗乙肝病毒药物治疗。
如果乙肝表面抗原阴性、核心抗体阳性，在口服抗丙肝病毒药物治疗过程中也有乙肝病毒再激活的风险，应每月监测一次乙肝病毒DNA、乙肝表面抗原。
若出现阳性，应口服抗乙肝病毒药物治疗。