胚胎停止发育原因很多，如果是做试管婴儿的情况下，和正常的自然受孕胚胎停育的原因差不多，具体如下：
第一、和胚胎本身染色体有关系，比如出现染色体数目的异常、染色体的缺陷。另外，母体的因素也是导致胚胎停育常见的原因，比如出现严重的代谢性疾病、内分泌性疾病以及免疫方面的问题。
第二、环境的因素，比如受到电磁污染，或者孕妇在妊娠期间口服严重致畸的药物，也会导致胚胎停止发育。
第三、精神过于紧张，甚至受外界的撞击或者剧烈运动等，都是导致胚胎停止发育的原因。
总之，做试管也会导致胚胎停止发育，和自然受孕一样。因为试管只是受精的过程在体外进行，但是胚胎的着床和生长发育均和正常的自然受孕一样，也会发生胚胎停育这种情况。