结肠息肉活检后发现是恶性，需要行手术治疗。息肉活检提示恶性的意思就是息肉已经癌变，已经发展成结肠癌，所以患者需要及时配合医生行手术治疗，目前手术治疗是唯一可能根治结肠癌的方法。如果没有出现任何转移，一般行外科手术切除。
如果是结肠早癌，患者也可以行结肠镜下治疗，主要用的是高频电凝电切除术。如果病变已经出现转移，需要联合做化疗，还有可能只是做造瘘、姑息等手术，具体需要咨询专科医生。