肝囊肿超过5cm，并且合并相应的症状，或者肝囊肿超过10cm，才需要考虑手术。另外，肝囊肿不论大小，如果出现了囊内的出血、感染、胆瘘等情形，并且引起了相关的症状，也要考虑手术。所以并不能统一按肝囊肿多大来作为手术指征，要根据患者本身的情况，以及肝囊肿的严重程度进行综合判定。
肝囊肿属于一种良性病变，增长极为缓慢，一般并不会出现恶变。针对比较小的囊肿，定期复查、随访即可。只有针对囊肿较大，引起了相关症状，或者囊内出现异常的情况，才需要考虑手术治疗。手术可以采用肝囊肿开窗，将肝囊肿的顶去掉，让囊液吸出，这种情况下能够得到很好的肝囊肿治疗效果。