子宫肌瘤的病因目前还不特别清楚，但是子宫肌瘤由于多发生在育龄期，在青春期前以及绝经以后会萎缩，所以这些临床征象提示肌瘤的发生可能和性激素有关系，尤其是雌性激素或者一些孕激素与子宫肌瘤的发生有相关性，在临床上常会有一些家族性的聚集，比方姐妹、母女，甚至一个家族里多数女性都会长子宫肌瘤，研究也提示，这与染色体的异常或者某些基因突变有相关性。
子宫肌瘤的发生，与遗传、内分泌代谢有相关性。当然与饮食也有相关性，因为某些食物里可能会有女性激素，尤其是雌激素和孕激素的相关前体物质，可能在体内也代谢为雌激素或者孕激素，有促进子宫肌瘤生长的作用。