引起扁桃体发炎的细菌种类比较多，比较常见的是乙型溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌，也有部分患者是由于肺炎链球菌所导致。具体的细菌种类有个体差异，在发病之后建议到耳鼻喉科就诊，可以取扁桃体表面的分泌物做细菌培养和药物敏感试验，通过细菌培养有助于明确具体的细菌种类。
在治疗方面，一般可以选择经验性用药，比较常用的就是头孢类或者青霉素类的抗生素，用药治疗周期一般是在一周。在治疗过程当中需要定期复诊，观察效果。有部分患者可以选择口服中成药物和雾化治疗，也具有辅助性的治疗作用。