甲硝唑凝胶治疗痘痘，主要应用于痤疮或者红斑痤疮，通常出现面部炎症性表现，如毛囊炎性丘疹、粉刺、脓疱等厌氧菌感染时的皮疹，应用甲硝唑凝胶2次/日涂抹，还可以起到杀灭螨虫的治疗目的。
在治疗前需要将痘痘进行螨虫化验，如果有相应的阳性表现，同时还应该配合口服甲硝唑片，以及共同混合外用克林霉素磷酸酯凝胶，或者夫西地酸软膏涂抹加强抗菌的治疗目的。治疗期间要避免日光的暴晒，避免大量饮酒。