上完厕所擦肛门时纸上有血迹可能有以下几种原因：
1、最常见的是痔疮，常常由于排便时通过痔疮的表面将局部划伤，形成的便后滴血。痔疮属于一种良性的疾病，一般出血可以自行的停止。
2、可能是直肠肿瘤，由于排便时对肿瘤的表面有擦伤，引起纸上有血迹。
3、可能是肛裂，一般这时伴有明显的疼痛，而且难以耐受。
如果上完厕所时擦肛门纸上有血迹，建议到正规的专科医院系统的检查后明确诊断。