临床上菌类中毒，都是误食了有毒的野生菌。误食野生菌之后临床上会有相应的症状，如果考虑中毒，在六小时之内没有洗胃禁忌症的情况下，要给予患者彻底的清除毒物，采取洗胃的方式。最好是采用机械洗胃，可以结合导泻、活性炭吸附，彻底清除尚未吸收的毒物，这是第一步。
第二步是对症处理，因为毒蕈中毒临床上损害可能表现不一样，不同种类的毒蕈临床症状也不一样。有些患者可能仅是胃肠道症状，这样的患者对症处理就可以，比如应用阿托品进行对抗，对症治疗问题不大。但临床上有些患者毒蕈中毒，可能会造成肝损害或凝血功能障碍而出现溶血，出现神经系统症状。
严重的患者可能需要采取血液净化的方式，比如血浆置换，肝损伤严重者可以考虑应用人工肝等治疗。轻中重度问题都不大，但重症中毒一定要在医生指导下，根据患者中毒损伤的脏器不同，采取不同的治疗措施。