对于贲门癌早期的患者，一般首选手术治疗，手术能够切除肿瘤细胞但对微小病灶无能为力，术后容易复发和转移，所以术后的治疗也很关键。一般手术我们采用全切加局部淋巴结的清扫，术后主要以传统的化疗、免疫治疗、局部放疗为主。化疗会给患者带来很大的痛苦和副作用，如果患者不能耐受化疗，建议患者进行免疫治疗。化疗虽然可以杀死癌细胞，但没有识别能力，同时会杀伤正常的细胞，患者会出现恶心、呕吐等症状，长期的化疗还会影响患者的免疫力，所以需要生物免疫治疗以减轻化疗的副作用，增强患者的免疫力，生物免疫治疗可以清除术后残留的微小病灶，控制肿瘤的复发和转移。
另外还可以采用中医中药的方法来调理患者的病情，通过综合的治疗方法，来提高患者的生活质量，延长患者的生命。目前的分子靶向药物也非常有效果，有条件的患者可以做一个基因检测，有基因突变的可以吃分子靶向药物。