凌晨三四点咳嗽多是由肺病引起，但也要注意其他的病因，具体情况如下：
1、哮喘：凌晨三四点咳嗽，多见于变异性哮喘或支气管哮喘患者，哮喘患者多于晚间和凌晨时好发，其咳嗽症状亦在此时有加重的特点。患者多需要完善胸片、呼出气一氧化氮测定或支气管激发试验等来明确诊断。
2、呼吸道感染：还要注意部分呼吸道感染的患者，例如肺结核、肺炎也可以有凌晨时咳嗽。
3、肺癌：有时肺癌患者因咳嗽剧烈频繁，在凌晨3-4点时仍有剧烈的咳嗽。
4、其他疾病：上述咳嗽病因都是由肺部相关疾病引起，但某些心脏疾病也可以引起凌晨3-4点咳嗽，例如心力衰竭患者，凌晨时出现咳嗽同时伴有喘闷症状，有时胃食管反流性咳嗽也可以在凌晨3-4点发生咳嗽。