如果在月经期间小腹疼痛、肛门坠胀，可能的原因主要包括以下几个方面：
1、直肠、肛周病变：比如肛瘘、肛周脓肿，也可能是由于痔疮，尤其是痔疮合并感染或者血栓性外痔时更容易出现。
2、直肠癌或肛管癌：也会导致小腹疼痛、肛门坠胀。
3、盆腔积液：盆腔积液可能是由于妇科相关的炎性病变，比如附件炎等导致。
如果发现在月经期间小腹疼痛、肛门坠胀，建议还是及时到正规的专科医院找肛肠科医生，以及妇科医生完善相关检查，明确诊断，然后再根据不同的病因及时对症治疗。