卵巢囊肿手术后的复发率是不能一概而论的，卵巢囊肿手术后是否会复发与卵巢囊肿的性质密切相关。卵巢囊肿在临床上有几种常见的类型，具体如下：
第一、最常见的是卵巢生理性囊肿，也就是发生在月经后半期，而在月经之后会逐渐缩小甚至消失的卵巢囊肿，这种情况大多数不需要进行手术治疗，只有当卵巢囊肿过大或者持续不消失，才考虑进行手术治疗；
第二、比较容易复发的卵巢囊肿是卵巢子宫内膜异位囊肿，也就是卵巢巧克力囊肿。卵巢子宫内膜异位囊肿是女性子宫内膜异位症的一种表现形式，卵巢子宫内膜异位症往往由于反复的精血灌注到囊内，导致卵巢囊肿逐渐增大，甚至可能会导致囊肿的破裂，同时合并有盆腔内的子宫内膜异位病灶，因此当手术后，卵巢囊肿剥除以后，盆腔内仍然存在有活性的子宫内膜异位病灶，或者卵巢功能较为活跃，都可能会导致卵巢子宫内膜异位囊肿的复发。因此对于卵巢子宫内膜异位囊肿，在手术后建议常规的给予预防复发的巩固治疗。