彩超和核磁共振是两种完全不同的检查方式，区别主要有以下几点：
1、二者的成像原理不同，彩超主要利用超声波对人体进行扫查，核磁共振主要利用外加磁场对人体进行扫查。
2、彩超适合所有人群，没有什么特殊的禁忌证，核磁共振有绝对禁忌证和相对禁忌证，不是所有人都适合做核磁共振检查。
3、适应证不同，彩超比较适合于实质性脏器、小器官以及心血管系统疾病的检查，核磁共振更适合于中枢神经系统、腹部以及软组织疾病的检查。