自身免疫性肝病包含有三种疾病，分别是自身免疫性肝炎、原发性胆汁性肝硬化、原发性硬化性胆管炎。这三种疾病都是因为自身免疫功能的紊乱所引起。目前疾病的病因不十分清楚，遗传易感性应该是主要的因素。在遗传易感性的基础上，机体的免疫耐受状态被打破，产生针对肝细胞的抗原反应，从而引起肝细胞的损害，会引起肝细胞的炎症、纤维化，甚至肝硬化。