脊索瘤复发在所难免。因为肿瘤的生物学特点，就是破骨性的生长，破骨性生长之后，做手术的时候在内镜放大的情况下，把肿瘤全切，已经切到肿瘤边界。但是，像已经侵入到骨质内肿瘤细胞，是难以发现的在内镜下。这时候有复发的可能。为了避免复发，术后一般都采用放射治疗。但是普通的放射治疗，伽玛刀治疗、X刀治疗效果并不尽人意。现在比较推量子刀、质子刀，可能效果比较好。但是，量子刀和质子刀的费用就比较高。