患者要确诊肺结核，只有查到结核分枝杆菌或者培养出来分枝杆菌，才是确诊结核的依据。第二种依据是病理学检查，也就是要取到肺组织里面有结核特征性改变，才能确诊为结核，只有这两个标准，具体如下：
一、细菌学的检查：目前简易的方法有以下两种：
1、痰涂片：查结核菌，如果阳性就可以确诊，但是需要两次。
2、痰培养：只需要一次就行，但是费时，时间比较长，常常有两周到一个月，甚至两个月才能出结果。
二、病理学检查：
有介入和手术两种方法，在气管镜引导下做肺组织的活检，或者用手术切除肺标本进行活检，来确诊是不是结核。除此之外，在组织细胞内可以做TB-DNA检测，作为诊断结果之一。做气管镜的时候做肺泡灌洗，可以做培养、细菌学检查，涂片或培养查到结核菌也可以作为诊断的依据。
简单的查结核菌的方法就是痰涂片和痰培养，复杂一点的方法最常用的是做气管镜，气管镜灌洗查到结核菌，或者是组织病理学查到结核菌，都可以认为是确诊。