甲硝唑是控制口腔厌氧菌感染的一种有效的抗生素，能对于引起牙周病的厌氧菌起一定的治疗作用，但是对牙周病只是治标不治本。因为这些厌氧菌存在于牙龈或者是牙周袋当中，附着在牙齿上。如果不去除牙石或者是不进行牙周袋中肉芽组织的清理，单纯只应用口服的药物，只能抑制细菌而不能杀灭细菌。因为这些细菌存在的环境仍然存在，所以虽然细菌被暂时杀灭，其他的还会在牙齿上重新生长。因为口腔本身就是一个有菌的环境，而不能单纯通过药物完全控制细菌的滋生。