扁平疣存在自愈可能，但每个人自愈的时间各不相同，有的人可能需要半年至一年。但也有人可能多年不愈，相对较多见的情况是1-2年，最多三年内自愈。自愈机制主要是机体免疫系统逐渐产生了针对人乳头瘤病毒的抗体及免疫反应，能将局部病毒感染的组织加以排斥、清除，扁平疣即可自发消退。但由于每个人免疫功能和免疫应答产生的时间各不相同，所以扁平疣自愈的时间也很难预料，有些持续不退的患者还是需要进行治疗才能消退。
扁平疣是由人乳头瘤病毒，也叫HPV病毒感染所引起的一种常见病毒性皮肤病，主要好发于颜面部、手背及前臂部，表现为多发、质硬、黄褐色的小丘疹。