扁平疣最常用的治疗方法是物理治疗，比如液氮冷冻或者是激光治疗，但是有一些数目居多、物理治疗损伤太大，可以口服异维A酸胶丸、肌肉注射干扰素，大部分治疗效果也是不错的。
扁平疣是人乳头瘤病毒HPV感染所导致的，HPV没有特效药物，所以治疗主要是靠物理治疗，比如液氮冷冻或者是二氧化碳激光，但是一次可能去不干净，需要重复的治疗，即使去干净了也可能还会长新的。
如果是数目太多，物理治疗损伤很大，不好操作，可以注射干扰素，口服异维A酸胶丸会有一定的效果，但是周期比较长很麻烦。
总之，扁平疣最常用的治疗方法还是液氮冷冻、激光治疗等物理治疗的方法。数量居多的、担心物理治疗留下疤痕，或者是色素沉着的，也可以通过口服异维A酸胶丸、肌肉注射干扰素进行治疗。