住院的核磁共振检查能报销，但是通常只能够报销一部分。具体报销比例与患者所交的医保类型有一定的关系，比如农村合作医疗的报销比例通常会稍微低一点，而城镇职工医保报销的比例可能会稍微高一点。
比较好的单位医疗保险可能会报销90%左右，还有的患者有可能交商业保险也能报销一部分。对于具体报销的比例，患者可以咨询医保科，会给予具体的答案。如果是商业保险，患者要咨询保险公司，看患者交的哪种商业保险，是一次性付清还是按照比例给付。