霉菌性阴道炎的治疗，一般是选择局部或者全身使用抗真菌的药物，根据患者临床分类决定疗程的长短，治疗措施大致如下：
1、单纯性的霉菌性阴道炎治疗：一般选择局部短疗程的抗真菌药物。全身用药和局部用药疗程相似，治愈率都可以达到90%左右，用药2-3天症状减轻或消失。咪唑类的药物疗效要高于制霉菌素，疗程为7-14天左右；
2、复杂性的霉菌性阴道炎：不论是采用局部用药或者全身用药，就应该适当延长治疗时间，一般是选择初始治疗7-14天后，然后维持治疗，连续用六个月左右，六个月一般是间断的用药，每周用药一次，连续用六个月；
3、反复发作的霉菌性阴道炎：也需要对真菌进行培养，判断是否是由于非白色假丝酵母菌感染，所引起的阴道炎症。
对于霉菌性阴道炎的治疗，单纯性的是以7-14天为一个疗程，大多数症状可以在用药2-3天症状消失，对于复发性的或者复杂性的霉菌性阴道炎疗程应该适当延长，为平时的2-3倍。经过规范的药物治疗，大多数霉菌性阴道炎都可以得到根治，在进行药物治疗前，消除诱因也是一项非常重要的辅助治疗措施。