HPV检查不会疼，这是无创性检查。医院检查HPV的时候是用窥阴器撑开阴道，暴露宫颈，医生用特制的小刷子在宫颈口周围轻轻的刷几次，这个时候不会有疼痛的感觉，将提取有分泌物以及脱落细胞的刷子，放进放有试剂的瓶子里面，送去化验，去做检查就可以。HPV的检查有两种方式：一种是做HPV-DNA检测，是做定量的检查；另一种是做HPV的分型检测，HPV分型检测主要是分成高危型和低危型。
HPV目前发现的亚型有160多种，根据致癌的潜能，可以将其分为高危型和低危型，其中高危型HPV感染是重点要检查的内容，因为HPV高危型与宫颈癌关系非常密切。HPV低危型的感染在人体内经过4-5个月，可以被自然清除掉，所以如果发现是低危型的感染，可以不做任何处理，但是低危型HPV感染如果引起生殖系统的疣，就需要对症处理，进行对症治疗。