植发手术对头皮有一定伤害，但是伤害作用非常有限。传统的毛发移植手术对头皮比较有伤害，是由于切取皮条的这种方式，会在头皮上留下大概20cm长的瘢痕，由于这个瘢痕在后枕区的位置，相对比较隐蔽，待头发生长长度超过1.5cm之后就可以完全遮盖。
对于移植区位置的毛发，由于必须打孔之后才能进行毛发的移植，打孔的操作对头皮也有一定损伤，但是现在的微针打孔技术，由于穿刺针的直径都是在1mm以下，对于求美者头皮的损伤相对都减少了很多，现在的微针法毛发移植手术对头皮的伤害最小。