目前对于手足口病的预防，主要是在天气炎热的时间之内，避免到人特别多的场所去，也要避免与手足口病的患者相接触。手足口病的预防也可以采用疫苗，但目前的疫苗仅仅是针对肠道病毒71型的疫苗。
如果今后有其它的疫苗上市，也有可能能够达到预防其他种类病毒的目的，从而能够从根本上预防手足口病。关于手足口病的治疗，需要看手足口病患者的具体症状。
如果症状比较轻，可以简单的注意休息、多饮水，并且服用清热、解毒的中成药就可以。如果手足口病有比较明显的症状，比如发热，可以应用对症的退热药物。如果症状比较重，出现精神状态特别差，甚至出现脑炎、脑膜炎。
这时需要应用一些抗炎的药物，比如应用糖皮质激素，或者是应用脱水、降颅压的甘露醇，这时的治疗就必须住院才能够进行。