手淫后小腹疼痛，应当戒除手淫的习惯，然后根据相关检查明确诊断后对症进行治疗。手淫是不良的习惯，长时间频繁手淫会对身体造成一定伤害。患者手淫后小腹疼痛，考虑是由于长期手淫而引发的慢性无菌性前列腺炎。建议患者可以到正规医院进行前列腺液常规检查明确诊断，如果确诊为慢性无菌性前列腺炎，彻底治愈比较困难。患者应当戒除手淫的习惯，然后在医生的指导下口服抗生素药物及中成药联合进行治疗，例如左氧氟沙星、前列舒通胶囊联合应用，但患者需要长期坚持治疗，才会逐渐痊愈。平时不要久坐，不要着凉，忌辛辣、刺激性食物。上述是患者手淫后小腹疼痛的治疗方法，建议患者应当到正规医院进行检查明确诊断，在医生的指导下对症治疗。