鸡眼和跖疣在临床鉴别上是非常简单，虽然都是角化性的外观，而且都是发生在脚底部位。鸡眼主要表现为不是突出皮面的角化性增生，但是跖疣是突出皮肤表面的角化性增生，形成疣状外观。
鸡眼由于是形成圆锥体的，倒扣在人的脚底部，通过挤压以后疼痛比较明显。但跖疣虽然有点疼痛，但是疼痛的显著程度不是很强烈。鸡眼一般是单发，跖疣属于多发。鸡眼属于摩擦而形成的疾病，但是跖疣属于感染性的疾病，主要是由于HPV感染而形成。