做试管婴儿月经第二天主要是检查以下项目：
1、性激素五项：性激素五项查的是孕激素、雌激素、促卵泡生成素和促黄体生成素，极少数人同时还要复查泌乳素，检查目的主要是检查经过降调节以后，也就是应用药物以后对垂体抑制的程度，看雌二醇和孕激素是不是抑制到一定的程度，尤其是黄体生成素和卵泡生成素是否达到比较低的状态，是否能启动外源性的促性腺激素，促进卵子整体的生长。
2、B超检查：除了抽血化验以外，还要做B超检查，B超检查主要是看窦卵泡数。同时要排除卵巢是否有功能性囊肿，比如上一次月经是否形成黄体囊肿，以免在监测卵泡的过程中受黄体囊肿的干扰和影响。