足背腱鞘囊肿如果较小者，部分患者可以自行消退，而较大者通常不能自行消退，具体情况如下：
第一、足背的腱鞘囊肿比较小，不影响关节功能，不需要特殊处理，部分患者囊肿可以自行吸收。
第二、较大的腱鞘囊肿通常不能自行吸收，需要人工治疗，可以将囊肿挤压破裂，使囊内胶状液体经皮下吸收后，囊肿可能会消失。
第三、可以选择刺破封闭疗法，使用注射针头将囊肿内的液体吸出，同时注入醋酸泼尼松龙，局部加压包扎，一般情况下2-3次可以痊愈。如果此类方法均无效，则需要采用手术切除，完整暴露腱鞘囊肿，连同周围腱鞘、腱膜彻底切除。