化脓性腮腺炎与流行性腮腺炎的区别在于，流行性腮腺炎是传染病，主要是由于腮腺炎病毒引起的传染病。化脓性腮腺炎是非传染病，大多数是由于细菌引起，与各种原因引起的唾液潴留、淤滞有关。
急性化脓性腮腺炎可以由金黄色葡萄球菌引起，慢性化脓性腮腺炎可以由重金属中毒引起。急性化脓性腮腺炎多为一侧，由于是由细菌感染引起，所以发病急，出现高热、寒战、白细胞增多。慢性化脓性腮腺炎多为双侧，腮腺肿胀反复发作。流行性腮腺炎腮腺肿大是非化脓性的肿大，腮腺以一侧先肿胀，之后波及另一侧。肿胀时以耳垂为中心，向前、向后、向下播散。