小肠套叠的主要症状有以下几点：
第一、腹痛，呈急性发作，阵发性加剧，对于小孩主要表现为阵发性的哭吵，如果既往身体健康的小孩突然出现阵发性、有规律的哭闹，伴有手足乱动、面色苍白、异常痛苦的表现，然后会出现短暂的安静，如此反复发作，要考虑肠套叠的可能性。对于一部分身体比较弱的小孩，会出现萎靡不振、反应减退或者烦躁不安。
第二、血便，主要表现为果酱样血便，大多数小孩的肠套叠会发生血便，主要是因为肠系膜嵌入到肠壁间发生血液循环障碍，引起肠黏膜出血，常常表现为果酱样的血便。
第三、腹部的包块，一般在腹部可以明显的摸到有包块的现象，严重的做肛门指诊时在直肠内可以触到肿物。
第四、全身会出现面色苍白、烦躁不安、脱水、电解质紊乱、嗜睡、反应迟钝等表现，部分患者还会有剧烈的呕吐，有些患者会吐出有臭味的肠内容物。