在临床工作中发现HPV(人乳头瘤病毒)检查阴性，同样有一部分患者还是会患宫颈癌。这种患者可能和自身的免疫功能，以及细胞的调控异常有关，目前HPV病毒感染，特别是高危型HPV病毒感染是引起宫颈癌的基本原因，但是也有其他的相关因素，比如早年的分娩、多产、高危男性性伴侣，以及机体免疫功能抑制等，都是导致宫颈癌发病的一些相关的因素。
宫颈癌的患者大部分会感染HPV病毒，所以目前认为HPV病毒是导致宫颈癌发病的一个最重要的原因，尤其是高危型的HPV病毒，HPV病毒感染持续存在，可以引起宫颈癌前病变和宫颈癌。致癌的机制是认为HPV病毒持续感染，导致宫颈的局部微环境改变，使HPV病毒整合在宫颈上皮细胞的染色体，异位产生E6、E7癌基因，所以会产生细胞调控失常，进而发展成为宫颈癌前病变。
随着时间的延长，发展成为宫颈癌，一般患者从宫颈上皮内病变发展到宫颈癌大约需要10-15年的时间，但是大约有25%的患者，可能在五年内就发展成为宫颈的浸润癌。