大肠埃希菌感染引起的尿路感染，比较敏感的首选抗生素，包括左氧氟沙星片、呋喃妥因片、磺胺嘧啶片，需要持续的口服治疗足够长的时间，才能够彻底的清除大肠埃希菌。
由于大肠埃希菌相对来说是比较顽固，容易复发，所以在治疗以后，需要定期进行尿培养检查，了解是否存在尿路感染复发的情况。在预防尿路感染复发的阶段，也可以选择清热、利湿、通淋、利尿的中成药，比如三金片、热淋清胶囊、八正胶囊，对症治疗有很好的效果。在治疗期间要避免辛辣、刺激的饮食，不要喝酒，每天至少要喝水2000mL，充分利尿既能够帮助尿路感染的康复，又能够阻止细菌的滋生、复发。