新生儿唐氏综合征又称为21-三体综合症，主要的临床表现是新生儿出生以后活动少，大约90%的新生儿拥抱反射不能引出，头围小、形状比较偏圆、短头、枕部扁平，可以有特殊的面容，脸比较圆扁、眼裂小、鼻梁偏平、眼距比较宽。
大部分新生儿有伸舌，其次还有颈比较短宽，颈周皮肤松弛，大约有一半的21-三体综合症的新生儿合并有先天性的心脏病以室间隔缺损比较多见。
有些有胃肠道的畸形，如十二指肠狭窄或者是闭锁，有些也会合并有肛门闭锁，手比较宽，手指短，第五小指内仅有一条横纹，以上都是21-三体综合征新生儿的表现。