临床上医生诊断卵巢早衰大多数根据FSH的水平来决定，一般患者FSH的水平大于30U/L以上多提示卵巢的功能低下，此时还有结合雌激素和孕激素的水平来决定。FSH水平升高，雌激素孕激素水平降低，就提示卵巢功能的下降，提示有卵巢早衰的可能。
另外，卵巢早衰比较重要的点就是年龄在40岁之前出现的症状，女性在40岁以后正常的卵巢就处于下降状态。所以40岁以后出现的FSH升高、雌孕激素的下降，不能诊断卵巢早衰，因此FSH可以作为卵巢早衰的诊断标准，其标准值为30U/L。