包茎手术又称包皮环切术，整个手术过程在麻醉状态下进行，所以不会有痛感。不过麻醉药失效以后，可能伤口会有疼痛的感觉。如果安静的休养或者是减少活动，痛感不会太强烈，但是如果频繁的走动、活动或者反复勃起，伤口还是会比较疼痛。
手术以后医生会给患者开一些口服的镇痛药，如果确实感到疼痛，可以吃止痛药来缓解疼痛，以免影响休息和睡眠。包皮环切手术绝大多数人采用的是局部麻醉，一般是采用1%-2%的利多卡因溶液在阴茎根部进行环形阻滞，少数不能配合的儿童可能会采用基础麻醉，又称为静脉复合麻醉，通常术后麻醉药的作用能够维持2-3个小时。