通常尖锐湿疣是长在外生殖器上，有时因为性交方式不同可能会在肛周出现，极少数情况下，会因生殖器接触乳房，而导致乳房出现尖锐湿疣，但比较罕见。尖锐湿疣通常没有症状，少数患者会有异物感、疼痛、瘙痒，多数患者是发生在外生殖器及肛门周围的皮肤黏膜湿润区域。
男性主要发生在龟头、冠状沟、包皮系带、尿道口、阴茎以及会阴，女性一般发生在大小阴唇、阴道口、阴蒂、阴道、宫颈、会阴及肛门周围，同性恋人群一般发生在肛门及直肠内，发生在肛门生殖器以外的部位极为罕见。