肛门脓肿术后，半个月左右的时间就不是太疼了，因为半个月之后新长出来肉芽，把原来创面裸露的神经覆盖，不管是换药、排便或者是冲洗，都不会刺激到原来裸露的神经，所以疼痛在这个时候会有明显的减轻，一般不会影响患者的生活。
肛门脓肿的手术，据统计是比较疼痛的手术之一，因为肛门周围的神经比较丰富而且敏感。肛门脓肿的手术创面会比较大，术后患者经常疼痛的比较厉害，目前还没有特别有效的做到肛门脓肿术后无痛的这种措施，能做到的就是伤口的换药、勤洗浴创面，让创面能够正常的生长。