目前颅咽管瘤的大多数患者还是建议采取手术方式进行治疗，在手术过程中显微镜下尽可能暴露颅咽管瘤，将颅咽管瘤进行完整切除，术后留取少量肿瘤组织做病理切片，根据病理切片的结果判断目前肿瘤性质和恶性程度。另外对体积特别巨大的肿瘤或肿瘤周围有重要的血管、神经，难以做到完整切除的情况下建议选择做部分切除，手术以后配合局部进行放疗、化疗等相关治疗。较大的囊性单腔性颅咽管瘤还可以考虑使用同位素进行放疗，较小的颅咽管瘤也可以选择使用立体定向放射外科来治疗。