头痛低烧的原因有全身性原因和局部原因，建议患者到医院就诊，查明原因，进行相应的检查。
全身性原因是病毒感染，比如上呼吸道的病毒、感冒病毒所导致的头痛、低烧。但如果是局部的原因，有可能是耳源性、眼源性，头颅本身的神经系统的感染都可以导致，比如中耳炎本身可以导致头痛、低烧。如果眼睛感染，也可以导致头痛、低烧。如果是脑实质的神经系统感染，本身就可以导致头痛、低烧，出现脑膜炎、脑实质炎症的改变。所以头痛、低烧，至少从感染的角度来讲，有全身性的和局部源性的原因。
患者要到医院完善血常规和C-反应蛋白的相关检查，同时需要遵医嘱对症应用解热镇痛的药物，比如对乙酰氨基酚或者吲哚美辛栓，效果较好，但是最重要的是治疗原发病。