预防疟疾可以应用伯氨喹啉，目前还没有有效的疫苗可以预防疟疾。预防疟疾主要应该通过消灭蚊虫，避免蚊虫叮咬，同时要保持家庭卫生的干净、整洁，以及注意通风。
在外出时应该穿长裤或长袖衬衫，挡住皮肤，在皮肤和衣服上涂抹驱虫剂或者是喷雾剂。睡眠时最好睡在蚊帐里，特别是用杀虫剂处理过的蚊帐里，有助于睡眠时防止蚊虫叮咬。如果要前往疟疾流行的地区时，可以提前几个月与医生讨论，是否应该在旅行之前、期间或之后服用药物，以帮助免受疟疾寄生虫的侵害。