男性尿道最狭窄的部位位于尿道外口，也就是尿道末端，龟头前正中部位的开口处，另外还有两个狭窄处，一个是尿道起始部，也就是尿道与膀胱连接的部位，另一个是叫尿道膜部，也就是尿道穿过尿道括约肌的部位。因此男性尿道一共有三处狭窄，最狭窄处位于尿道外口，这也是结石容易停留的部位。另外经尿道操作以后，如果出现医源性尿道狭窄，常常也是位于这三处狭窄，特别是位于尿道外口处。男性尿道还有两个弯曲，一个叫做耻骨下弯，另一个叫做耻骨前弯，分别位于耻骨下方和耻骨的前方。
女性尿道宽而短，并没有明显的狭窄处。由于男性尿道较长，又有三处狭窄。因此经尿道操作的时候要格外注意，以免引起医源性损伤，经尿道操作主要是指导尿、膀胱镜、输尿管镜检查以及手术。