肛瘘不治疗、不手术有一定的癌变倾向，从临床观察看，癌变的几率比较低，癌变的病例也是很少的。大部分都是病程比较长的，大部分肛瘘的病史在十年以上，不过几率低并不是没有，如果存在肛瘘，最好早期进行手术治疗。肛瘘是可以通过手术治愈的疾病，不管是复杂的肛瘘，还是低位简单的肛瘘，都可以经过手术进行彻底的治愈，可以解除癌变的风险。如果肛瘘长时间的不治疗，时间越长，癌变的风险相对更高。如果由一种良性疾病转化成恶性疾病，治疗是比较麻烦的，不管是费用还是治疗效果，都不是特别的好。