新生儿房间隔中断实际上就是新生儿房间隔缺损，属于先天性心脏病中的一种，房间隔缺损主要是由于原始的心房间隔发育、融合及吸收等异常，该病在先天性心脏病中占比约为5%-10%，发病率为活产婴儿的1/1500，是常见的先天性的心脏病，确诊主要是依赖于心脏彩超。
如果患者缺损比较小，临床没有症状，大部分在四岁之内可以自然的闭合，也就是自愈。如果缺损比较大，有时候会伴有左向右的分流，导致肺充血，新生儿在后期反复发生呼吸道感染，甚至会发生肺炎，如果有反复的并发症的发生，可以早期做介入治疗。