EB病毒DNA定量低于检测下限，说明有以下几种情况：
一、没有EB病毒感染：患者没有相应的临床表现，检查EB病毒IgM抗体也是阴性，这种情况提示没有EB病毒感染。
二、EB病毒感染已经进入到了恢复期：也就是之前有过EB病毒感染，患者有临床表现，如发烧、咽痛、淋巴结肿大、肝脏受损，经过抗病毒治疗之后，DNA已经获得阴转，或者患者没有经过抗病毒治疗，通过自身免疫力达到病毒控制，DNA已经阴转，但这时检查EB病毒的IgM应该是阳性，主要见于EB病毒感染已经进入到了恢复期。
三、病情相对比较轻：也有可能一开始到医院检查时EB病毒已经出现了阴转，但IgM抗体是阳性，因为EB病毒是一种自限性疾病，所以有些患者在入院就诊时DNA可能是阴性，但IgM抗体是阳性，这种情况也可以诊断EB病毒感染。