口腔病毒性的疱疹，主要是单纯疱疹病毒引起的，临床上的治疗主要采用抗病毒的药物，包括阿昔洛韦、干扰素等应用，必要的时候还需要应用免疫调节剂，包括胸腺素、转移因子等。
也可以局部用药控制症状，包括黏膜的糊剂、含片，如华素片以及氯己定含漱溶液，还有一些对症的支持疗法，进行止痛和消炎的治疗。
现在也有一定的中医中药进行治疗，包括口炎宁颗粒以及抗病毒颗粒等。因此如果出现口腔的病毒性疱疹，需要到医院就诊，通过用药控制症状。