核磁共振检查主要是利用磁场原理，对儿童身体部位做影像学检查，是非常好的寻找病灶的检测方法。其本身没有辐射，与核辐射完全是两件事。
所以儿童做核磁共振很安全，不用过于担心，只是可能会对儿童造成心理压力。因为做磁共振检查的时间比较久，儿童可能因此会有一定程度的恐惧心理，需要好好安慰儿童。
婴幼儿，特别是不配合的儿童可能需要镇静，吃镇静药可能会有增加睡眠的副作用，基本上没有远期危害，也不用过于担心，核磁共振检查出的疾病病灶本身才是家长应该担心的。