胆汁酸在胆囊中储存浓缩5-10倍，进餐后胆囊在胰腺分泌素的作用下发生收缩。在收缩的过程当中，胆囊的作用像马达一样驱动肠道循环。在肠道当中，各种形式的胆汁酸充分发挥各自的生理功能。
胆汁酸可以促进脂类的消化、吸收，抑制胆固醇在胆汁中析出、沉淀，防止胆石生成。胆固醇和卵磷脂的分泌，在很大程度上依赖于胆汁酸的分泌。胆汁酸有助于脂肪乳化，增强胰腺的汁解作用，胆汁酸在脂质代谢当中起着重要的调节作用。胆汁酸不仅参与胆固醇的调节，而且在三酸甘油的代谢中也发挥着重要的作用。胆汁酸为胆固醇代谢提供一条重要的排泄途径，胆汁酸可通过不同的机制调节葡萄糖的代谢。