儿童艾滋病的早期症状与成人基本相似，但由于儿童免疫力不健全，感染HIV病毒之后进展更迅速，会快速进入到艾滋病期。儿童艾滋病患者可见营养不良、发育异常，会出现明显的发育障碍，体重明显低于同龄的儿童，初期普遍有全身的淋巴结肿大，尤其是在颈部、腋下、腹股沟等处淋巴结肿大更为明显，肿大的淋巴结会持续存在，一般没有明显的压痛。
此外，患者早期可以见皮肤和黏膜损害，会出现弥散性的丘疹或疱疹，口腔可出现黏膜炎、溃烂，紧接着会由于各种机会性感染而出现消化系统、呼吸系统的并发症，可出现持续性的咳嗽、胸闷、呼吸困难、腹痛、腹泻等症状，并可以出现持续性的发热，体温一般大于38°C，持续时间可以超过一个月。儿童艾滋病病毒感染者，五岁以后死亡率可以达到90%以上，故儿童艾滋病患者应该尽早采取联合高效抗反转录病毒治疗，抑制病毒复制。