红霉素和金霉素都是抗生素，都可以用来治疗细菌等多种病原体的感染。在临床上常常用红霉素做成眼膏，用金霉素做成眼膏，但是它们之间还是有一些细微的差别。
主要的差别来源于它们属于不同的抗生素的种类，红霉素属于大环内酯类，而金霉素是属于四环素类。从抗菌谱来讲，它们两个的抗菌谱都比较广，但是青霉素更加要广一些，除像常见的革兰阳性菌、支原体、衣原体以外，青霉素还对立克次体等病原体有效果。在临床上应用时需要注意的是，如果是病人对于大环内酯类的药物过敏，不能用红霉素，如果要是对四环素类的药物过敏，就不能用金霉素。